การวิเคราะห์ข้อมูลจีโนมด้วย Bioconductor

การจัดลำดับเบสแบบ High-throughput สร้างข้อมูลจำนวนมหาศาลที่ต้องใช้เครื่องมือเฉพาะทางสำหรับการวิเคราะห์ที่มีความหมาย หลักสูตรนี้มอบเส้นทางที่ชัดเจนสู่โลกของชีวสารสนเทศศาสตร์ (bioinformatics) โดยแสดงให้เห็นถึงวิธีใช้ประโยชน์จากเครื่องมือที่ใช้ R เพื่อปลดล็อกข้อมูลเชิงลึกทางชีววิทยาจากข้อมูลทางพันธุกรรมที่ซับซ้อน คุณจะเปลี่ยนจากการจัดการข้อมูลพื้นฐานไปสู่การจัดการวัตถุจีโนมที่ซับซ้อน โดยได้รับทักษะที่จำเป็นในการจัดการข้อมูลทางชีววิทยาในโลกแห่งความเป็นจริง ผ่านคำอธิบายที่เป็นลายลักษณ์อักษรและตัวอย่างที่อิงตามโค้ด คุณจะได้เรียนรู้วิธีการสำรวจโครงสร้างเฉพาะที่ทำให้ระบบนิเวศนี้เป็นมาตรฐานอุตสาหกรรมสำหรับวิทยาศาสตร์จีโนม What you'll learn: - ทำความเข้าใจสถาปัตยกรรมพื้นฐานของวัตถุและโครงสร้างข้อมูลของ Bioconductor - ประยุกต์ใช้การดำเนินการช่วงจีโนม (genomic range operations) เพื่อระบุส่วนที่ทับซ้อนกันและคุณสมบัติต่างๆ ทั่วทั้งจีโนม - ประมวลผลข้อมูลการจัดลำดับเบสแบบ high-throughput โดยใช้เวิร์กโฟลว์มาตรฐานที่ใช้ R - จัดการเมทาดาตาจีโนมขนาดใหญ่และการออกแบบการทดลองได้อย่างมีประสิทธิภาพ - ฝึกฝนเทคนิคการทำความสะอาดข้อมูลและการทำให้เป็นมาตรฐาน (normalization) สำหรับการทดสอบจีโนมต่างๆ - ใช้รูปแบบการวิจัยที่ทำซ้ำได้ (reproducible research patterns) โดยใช้มาตรฐานการเขียนโค้ด R ที่ทันสมัย หลักสูตรเริ่มต้นด้วยคำศัพท์ที่จำเป็นและคำจำกัดความพื้นฐาน ก่อนที่จะเข้าสู่การประยุกต์ใช้แพ็กเกจหลักในทางปฏิบัติ คุณจะได้อ่านคำแนะนำโดยละเอียดที่แสดงให้เห็นถึงวิธีเปลี่ยนลำดับเบสแบบดิบให้เป็นผลลัพธ์ที่มีโครงสร้างและตีความได้ หลักสูตรนี้ออกแบบมาสำหรับผู้เริ่มต้นในสาขาชีวสารสนเทศศาสตร์ นักวิจัยด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพ หรือนักวิเคราะห์ข้อมูลที่กำลังเปลี่ยนไปสู่สาขาจีโนมิกส์ ไม่จำเป็นต้องมีประสบการณ์กับ Bioconductor มาก่อน แต่ความคุ้นเคยพื้นฐานกับ R จะเป็นประโยชน์ เริ่มสร้างรากฐานของคุณในวิทยาศาสตร์ข้อมูลจีโนมได้แล้ววันนี้