Метабркодинг 16S и метагеномный анализ с Galaxy

Понимание сложного мира микробных сообществ имеет важное значение для современных биологических и медицинских исследований, но необработанные данные секвенирования могут казаться ошеломляющими. Этот текстовый курс научит вас обрабатывать и интерпретировать данные 16S рРНК с помощью Galaxy, мощной веб-платформы, которая не требует программирования. К концу этого курса вы превратитесь из новичка в уверенного аналитика, способного запускать стандартные конвейеры метагеномики. Вы прочитаете четкие объяснения, поймете основные биологические концепции и научитесь интерпретировать таксономические профили. Что вы узнаете: Понимание основных концепций секвенирования рРНК 16S, меташтрих-кодирования и метагеномики; Навигация по интерфейсу платформы Galaxy для загрузки данных, запуска инструментов и управления историей; Выполнение контроля качества и предварительной обработки на чтениях сырой секвенировки для обеспечения надежных результатов; Классификация таксономических групп и сравнение операционных Таксономические единицы (OTU) с современными вариантами последовательности ампликонов (ASV); интерпретация показателей экологического разнообразия и таксономических диаграмм изобилия для вынесения биологических выводов. Курс начинается с основной терминологии и теории, лежащей в основе секвенирования маркеров, прежде чем пошагово провести вас через полный процесс анализа данных. Этот курс предназначен для начинающих, студентов и исследователей в области наук о жизни, которые хотят анализировать данные микробиома без написания кода командной строки. Не требуется предварительного опыта программирования или биоинформатики. Начните свое путешествие в анализ микробных данных и раскрыть секреты микробиома сегодня.