次世代シーケンシング: NGSデータ解析と応用

ゲノムデータの爆発的な増加により、次世代シーケンシング (NGS) は現代の生物学、医学、研究において不可欠なツールとなっています。この膨大な量の生物学的データを処理、解析、解釈する方法を理解することは、今日の生命科学者やバイオインフォマティシャンにとって重要なスキルです。このテキストベースのコースでは、NGSデータ解析パイプライン全体を通してガイドし、初心者から、生のシーケンシングファイルを扱い、意味のある生物学的洞察を抽出できる自信のある実践者へと変身させます。ゲノミクスの核となる概念を学び、さまざまなシーケンシングプラットフォームを理解し、研究および臨床現場で使用される標準的なワークフローを学習します。 学習内容: - 主要なNGSプラットフォームの基盤となる生化学と技術を理解する - 標準フォーマットを使用して、生のシーケンシングデータに対して品質管理と前処理を実行する - シーケンスリードをリファレンスゲノムにアラインし、遺伝子変異を特定する - RNA-Seqデータを解析して遺伝子発現レベルを測定し、差次的発現を検出する - シングルセルRNA-seqの概念やクラウドベースの解析を含む現代のゲノムワークフローを探求する - 現代のワークフロー原則を使用して、バイオインフォマティクスパイプラインに再現性基準を適用する 本コースは、必須の生物学的および計算上の定義から始まり、生のデータ品質評価からアラインメント、バリアントコーリング、そして下流の生物学的解釈へと論理的に進みます。このコースは初心者向けに特別に設計されており、事前のバイオインフォマティクスやプログラミングの経験は不要なため、ゲノミクス分野に参入する学生、研究者、臨床医に最適です。今日からゲノミクスの世界への旅を始め、シーケンシングデータ解析の基礎を習得しましょう。