ग्राफ थ्योरी के साथ जीनोम अनुक्रमण (सीक्वेंसिंग) और संयोजन (असेंबली)

आधुनिक जीव विज्ञान डीएनए को पढ़ने की क्षमता पर निर्भर करता है, फिर भी तकनीक अभी तक एक ही बार में पूरे जीनोम को संसाधित नहीं कर सकती है। यह कोर्स लाखों छोटे आनुवंशिक खंडों को एक साथ जोड़कर किसी जीव के जीनोम की पूरी तस्वीर प्रकट करने की आकर्षक कम्प्यूटेशनल चुनौती का अन्वेषण करता है। आप जानेंगे कि जीव विज्ञान और कंप्यूटर विज्ञान का मेल हमें जटिल पहेलियों को हल करने की अनुमति कैसे देता है, जो व्यक्तिगत चिकित्सा और विकासवादी अनुसंधान के लिए आवश्यक हैं। इस पाठ-आधारित पाठ्यक्रम के माध्यम से, आप एक शुरुआती से ऐसे व्यक्ति में बदल जाएंगे जो बायोइन्फॉर्मेटिक्स की एल्गोरिथम रीढ़ को समझता है। आप सीखेंगे कि जैविक डेटा को गणितीय संरचनाओं के रूप में कैसे दर्शाया जाए और न्यूक्लियोटाइड के सबसे संभावित अनुक्रम को खोजने के लिए तार्किक पैटर्न कैसे लागू किए जाएं। आप क्या सीखेंगे: - डीएनए अनुक्रमण की मूलभूत जैविक बाधाओं और खंड संयोजन (असेंबली) की आवश्यकता को समझें। - अतिव्यापी आनुवंशिक अनुक्रमों को व्यवस्थित और जोड़ने के लिए ग्राफ थ्योरी अवधारणाओं, जिनमें De Bruijn graphs शामिल हैं, को लागू करें। - ब्रूट फोर्स एल्गोरिदम के तर्क और छोटे प्रोटीन और पेप्टाइड्स के अनुक्रमण में उनके विशिष्ट अनुप्रयोगों का अन्वेषण करें। - पारंपरिक शॉर्ट-रीड अनुक्रमण दृष्टिकोणों की तुलना आधुनिक लॉन्ग-रीड कम्प्यूटेशनल प्रतिमानों से करें। - बायोइन्फॉर्मेटिक्स की शब्दावली में महारत हासिल करें, k-mers और contigs से लेकर Eulerian paths तक। - लिखित एल्गोरिथम अभ्यासों और तर्क-आधारित परिदृश्यों के माध्यम से संयोजन (असेंबली) चुनौतियों को हल करने का अभ्यास करें। यह कोर्स आधुनिक प्रयोगशालाओं में उपयोग की जाने वाली विशिष्ट ग्राफ-आधारित विधियों में जाने से पहले आवश्यक शब्दावली और डीएनए की जैविक नींव से शुरू होता है। आप संयोजन (असेंबली) तर्क की लिखित व्याख्याओं के माध्यम से आगे बढ़ेंगे, जिसके बाद उन एल्गोरिदम का चरण-दर-चरण विवरण होगा जो जीनोम पुनर्निर्माण को संभव बनाते हैं। यह कोर्स जीवन विज्ञान और प्रोग्रामिंग के मेल में रुचि रखने वाले शुरुआती लोगों के लिए डिज़ाइन किया गया है। शुरू करने के लिए बायोइन्फॉर्मेटिक्स या उन्नत गणित में किसी पूर्व अनुभव की आवश्यकता नहीं है। कम्प्यूटेशनल जीव विज्ञान की दुनिया में कदम रखें और जीवन की भाषा को समझना (डिकोड करना) शुरू करें।