Genom Dizileme ve Grafik Teorisi ile Toplama

Modern biyoloji DNA'yı okuma yeteneğine dayanıyor, ancak teknoloji henüz tüm genomu tek bir geçişle işleyemiyor.Bu kurs, bir organizmanın genomunun tam resmini ortaya çıkarmak için milyonlarca küçük genetik parçayı birleştirmenin büyüleyici hesaplama zorluğunu keşfediyor. Biyoloji ve bilgisayar biliminin kesiştiği noktanın kişiselleştirilmiş tıp ve evrimsel araştırmalar için gerekli olan karmaşık bulmacaları çözmemize nasıl olanak sağladığını keşfedeceksiniz. Bu metin tabanlı müfredat sayesinde, bir acemiden biyoenformatik algoritmik omurgasını anlayan birine dönüşeceksiniz.Biyolojik verileri matematiksel yapılar olarak nasıl temsil edeceğinizi ve en olası nükleotit dizisini bulmak için mantıksal paternleri nasıl uygulayacağınızı öğreneceksiniz Ne öğreneceksin: - DNA dizilemesinin temel biyolojik kısıtlamalarını ve parçaların birleştirilmesi gereksinimini anlamak. - De Bruijn grafiği de dahil olmak üzere, örtüşen genetik dizileri organize etmek ve birleştirmek için graf teorisi kavramlarını uygulayın. - Küçük protein ve peptitlerin dizilenmesindeki kaba kuvvet algoritmalarının mantığını ve özel uygulamalarını keşfet. - Geleneksel kısa okuma dizileme yaklaşımlarını modern uzun okuma hesaplama paradigmalarıyla karşılaştırın. - Biyoinformatik terminolojisini, k-merlerden ve contigs'ten Eulerian yollarına kadar öğren. - Yazılı algoritmik egzersizler ve mantık tabanlı senaryolar yoluyla montaj zorluklarını çözme egzersizini yapın. Kurs, modern laboratuvarlarda kullanılan özel grafik tabanlı yöntemlere geçmeden önce DNA'nın temel terminolojisi ve biyolojik temelleriyle başlıyor. Derslerde, montaj mantığının yazılı açıklamaları ve ardından genom yeniden inşasını mümkün kılan algoritmaların adım adım ayrıntılarıyla ilerleyeceksiniz. Bu kurs, yaşam bilimleri ve programlama arasındaki kesişimle ilgilenen yeni başlayanlar için tasarlanmıştır. Başlamak için biyoenformatik veya ileri matematikte önceden deneyime ihtiyaç yoktur. Hesaplamalı biyolojinin dünyasına adım atın ve yaşamın dilini deşifre etmeye başlayın.