Последовательность всего генома бактерий: биоинформатика и инструменты для начинающих

Поскольку секвенирование всего генома бактерий (WGS) быстро заменяет традиционные лабораторные методы в исследованиях и медицине, понимание того, как обрабатывать и интерпретировать геномные данные, стало важным навыком. Этот курс ликвидирует разрыв между микробиологией и биоинформатикой, ведущий вас через цифровой трубопровод, используемый для анализа бактериальных патогенов. Вы перейдете от понимания исходных данных секвенирования к извлечению практических биологических знаний. К концу этого курса вы будете понимать весь рабочий процесс WGS и будете чувствовать себя уверенно, используя цифровые инструменты, используемые для идентификации бактерий, обнаружения генов устойчивости и исследования вспышек заболеваний. Что вы узнаете: - Понять основные принципы структуры бактериального генома и современные технологии секвенирования - Проведение контроля качества и предварительной обработки исходных данных секвенирования с использованием современных биоинформатических инструментов - Изучить концепции сборки генома и как оценить качество сборки - выявление генов антимикробной устойчивости (АМУ) и факторов вирулентности на основе геномных последовательностей; - Использование публичных геномных баз данных и веб-инструментов для сравнения штаммов бактерий и отслеживания эволюционных связей Курс начинается с основополагающей терминологии, химической секвенирования и форматов данных, прежде чем двигаться шаг за шагом через контроль качества, сборки, аннотации и практических эпидемиологических приложений. Письменные объяснения и практические прогулки обеспечить вам построить прочную концептуальную и практическую основу. Этот курс предназначен для начинающих, включая микробиологов, медицинских специалистов, работников здравоохранения и студентов, не имеющих предыдущего опыта в области биоинформатики или программирования. Начните свое путешествие в бактериальной геномике и раскрыть мощь данных последовательности сегодня.