Sequenziamento del Genoma Intero Batterico: Bioinformatica e Strumenti per Principianti

Poiché il sequenziamento del genoma intero batterico (WGS) sta rapidamente sostituendo i metodi di laboratorio tradizionali nella ricerca e nella medicina, comprendere come elaborare e interpretare i dati genomici è diventata una competenza essenziale. Questo corso colma il divario tra microbiologia e bioinformatica, guidandoti attraverso la pipeline digitale utilizzata per analizzare i patogeni batterici. Passerete dalla comprensione dei dati di sequenziamento grezzi all'estrazione di informazioni biologiche utili. Alla fine di questo corso, comprenderete l'intero flusso di lavoro WGS e vi sentirete sicuri nel navigare gli strumenti digitali utilizzati per identificare i batteri, rilevare i geni di resistenza e indagare le epidemie. Cosa imparerai: - Comprendere i principi fondamentali della struttura del genoma batterico e delle moderne tecnologie di sequenziamento - Eseguire il controllo qualità e la pre-elaborazione sui dati di sequenziamento grezzi utilizzando moderni strumenti bioinformatici - Apprendere i concetti di assemblaggio del genoma e come valutarne la qualità - Identificare i geni di resistenza antimicrobica (AMR) e i fattori di virulenza dalle sequenze genomiche - Utilizzare database genomici pubblici e strumenti basati sul web per confrontare i ceppi batterici e tracciare le relazioni evolutive Il corso inizia con la terminologia fondamentale, la chimica del sequenziamento e i formati dei dati, prima di passare passo dopo passo attraverso il controllo qualità, l'assemblaggio, l'annotazione e le applicazioni epidemiologiche pratiche. Spiegazioni scritte e dimostrazioni pratiche ti garantiranno di costruire una solida base concettuale e pratica. Questo corso è progettato per principianti, inclusi microbiologi, professionisti medici, operatori sanitari pubblici e studenti senza precedenti esperienze in bioinformatica o programmazione. Inizia oggi il tuo viaggio nella genomica batterica e sblocca il potere dei dati di sequenza.